Steven T. Seagle

Depois de Gwen e Kevin foram embora, Ben está animado para se tornar um herói solo, mas o Vô Max tem outros planos. Ele escala um novo encanador, Rook, para ser o novo parceiro de Ben e ajudá-lo a explorar uma cidade subterrânea, a misteriosa Cidade de Baixo. Com um novo Omnitrix e 10 novos alienígenas, Ben terá que enfrentar novamente vilões do passado e também encarar uma nova ameaça: Khyber. Khyber é um caçador do espaço e está de olho em sua próxima caça: Ben. Ele porta o Nemetrix, um dispositivo criado pelo Dr. Psychobos por razões desconhecidas (talvez para tentar ser melhor que Azmuth, seu maior inimigo). Khyber tem um mascote que, com o Nemetrix, pode se transformar em 10 predadores que são capazes de derrotar os alienígenas de Ben, e será um desafio muito grande enfrentá-los. Além disso, o novo show trás de volta as aventuras do Ben de 11 anos, ainda com seus atos heroicos e com a ajuda de seu avô Max e sua prima Gwen. O jovem Ben descobre um novo alienígena, Feedback, que o irá ajudá-lo a enfrentar um novo vilão: Malware. Malware é um Mechamorpho Galvânico que sabe tudo sobre o Omnitrix e tem como objetivo destruir Azmuth. Ele é muito poderoso, e promete trazer muitos problemas para o herói.

Infectado por nanites alteradores de moléculas, Rex, um garoto de 15 anos, possui a habilidade de fazer crescer máquinas incríveis de seu corpo. Recrutado por uma organização chamada Providência, Rex viaja pelo mundo investigando grupos de mutações biológicas que foram criadas pelos mesmos nanites que deram a ele seus poderes.

Axel é um garoto que é capaz de se transformar em um brinquedo com vida. Com a substância que dá vida aos bonecos, ele recruta um time de aliados para derrotar as ameaças do vilão Madcap.