Naoko Takano

Kiritsugu e o jovem Shirou buscam uma forma de salvar o mundo, mesmo que isso signifique sacrificar alguns poucos pelo bem maior. Durante uma enorme catástrofe que engoliu Fuyuki, os dois encontram o último verdadeiro milagre da humanidade: a Criança de Deus. Dizem que as Crianças de Deus tem o poder de realizar qualquer desejo, mas seus poderes desaparecem com o passar dos anos. Numa guerra contra o tempo, Kiritsugu tenta encontrar a forma de utilizar a Criança, mas acaba tendo que deixar essa tarefa com o seu filho Shirou. Anos depois, os dias de felicidade na vazia Fuyuki chegam ao fim quando um ritual de matança recomeça após a Criança de Deus ser capturada: A Guerra do Cálice Sagrado. Tendo perdido tudo, Shirou está pronto para sacrificar seus ideais e todo mundo para recuperar a ferramenta de desejos onipotente… não, para resgatar a sua amada irmã.

Illyasviel von Einzbern é uma típica estudante do Instituto Homurabara que tem uma quedinha por seu cunhado. Certa noite, uma varinha de condão chamada Kaleido Ruby cai do céu em sua banheira e a faz assinar um contrato, e agora ela deve colecionar sete cartas que contém os espíritos de heróis lendários.

Tsubasa Shiina é uma menina de 10 anos que recentemente se mudou para Hokkaido para morar com o pai. Na escola, ela é muito quieta e anti-social com seus colegas. Então, uma noite, ela testemunhou um acidente de OVNI na floresta perto de sua casa. Ela corre para o local e encontra o piloto, codinome "DD", em uma condição quase estável. Também em cena está um Maguar, um alienígena horrível que eclodiu a bordo do navio de DD. Como o Maguar está perto de tirar a vida de Tsubasa, uma forma de vida alienígena se funde com seu corpo para formar a armadura de batalha Riberus Figura 17, que logo destrói a ameaça alienígena. A forma de vida leva o nome de Hikaru e se transforma em um gêmeo idêntico de Tsubasa. Com o passar do tempo, Tsubasa se torna mais aberta a todos ao seu redor, graças a sua nova irmã gêmea Hikaru. No entanto, com os ovos Maguar espalhados por todo Hokkaido.

A história da série se passa no ano de 2196, quando a Terra está em guerra contra uma raça de invasores alienígenas, os chamados "jupterianos". Após a derrota sofrida na Primeira Batalha de Marte, a Terra necessita de constante proteção em relação aos ataques desses inimigos, que utilizam naves não-tripuladas, tornando sua real aparência um mistério até os episódios finais. O destino do planeta então se encontra nas mãos da Nergal (ou "Industrias Nergal" como é apresentado no anime dublado), um poderoso conglomerado industrial que acaba de construir a última esperança para a salvação da Terra: uma poderosa nave de batalha, a ND-001 Nadesico. O que a Nergal não contava era que a tripulação seria o principal problema da nave.