Miki Nagasawa

Filme dividido em duas partes (Morte e Renascimento). Os eventos de "Renascimento" ocorrem 17 horas depois do final do Episódio 24. Tanto este filme, como o próximo (O Fim de Evangelion), caracterizam o "final alternativo" de Neon Genesis Evangelion. Os episódios 25 e 26, portanto, NÃO fazem parte deste enredo, onde a primeira parte é uma reedição dos primeiros 24 episódios do anime. A segunda parte consiste em uma nova animação e história que segue após o Episódio 24.

Um final alternativo para a série de anime "Neon Genesis Evangelion". Em The End of Evangelion, A SEELE ordena um ataque à NERV para destruir os EVAs antes que Gendo consiga provocar o Terceiro Impacto e a união das almas humanas.

Em pleno ano de 2071 Spike e seus companheiros ciganos do Esquadrão Bebop estão passeando pela cidade de Tóquio, até que Faye presencia um ataque bioterrorista, que mata cerca de 500 pessoas. Em busca de maiores informações sobre os responsáveis pelo ataque, o governo local oferece uma alta recompensa a qualquer informação entregue. O Esquadrão Bebop se interessa pela oferta e passa a usar suas táticas para encontrar o culpado pelo ataque.

Tokyo-3 permanece em pé após a maior parte da civilização ter sido dizimada no Segundo Impacto. Agora, a cidade sofre o ataque incessante dos estranhos e mortais Anjos, criaturas bizarras empenhadas em exterminar a raça humana. Para combater esse cruel inimigo, a agência governamental NERV constrói uma frota de máquinas humanóides (os EVAs) e Shinji Ikari é chamado para entrar em ação! Vivendo uma vida de solidão e questionando sua própria existência, Shinji se esforça para aceitar a responsabilidade para a batalha pela sobrevivência da humanidade.

Continuando de onde o último filme ("Evangelion 1.11: Você (Não) Está Só") parou, o filme começa com uma nova criança, Mari Illustrious Makinami, que pilota a Unidade 05 para destruir o Terceiro Anjo que ataca a base ártica da NERV.

No rescaldo do Quarto Impacto, presos sem seus Evangelions, Shinji, Asuka e Rei procuram refúgio nos desolados restos vermelhos de Tokyo-3. Mas o perigo para o mundo está longe de acabar. Um novo impacto está surgindo no horizonte - aquele que provará ser o verdadeiro fim de Evangelion.

No ano 2000, um grande impacto de um meteoro na Antártida derreteu o continente gelado, elevando o nível dos mares. Chegou-se a conclusão que Deus estaria tentando eliminar a raça humana e previu-se o envio de "Angels" para acabar com a humanidade. Preparando-se para isso, criou-se uma grande organização, custeada por todo o mundo: A NERV. Seu objetivo seria o de proteger a humanidade, pesquisando formas de defesa. Assim nasceram os Evangelions (ou EVA's): Gigantescos robôs pilotados por alguém com o dom de "sincronizar" com o sistema.

A história se passa em 1969, um período em que o Japão está passando por um desenvolvimento econômico e social intensa após o fim da Segunda Guerra Mundial, em 1945. Sem o conhecimento dos seres humanos, seres alienígenas de outra dimensão, chamados de "Invaders" (インベーダー, Invēdā?), surgem com o plano de dominar o mundo, enviando diversos agentes para causar estragos nas cidades, transformando as pessoas em lacaios dos robóticos. Na tentativa de deter os Invaders e defender o planeta, uma organização de elite altamente secreta chamada Alien Exterminating Global Intercept System (lit. Sistema Glboal de Interceptação e Exterminação de Aliens; A.E.G.I.S), foi criada com financiamento do governo. Eles contam com a capacidade dos "Gate Keepers", que têm o poder de abrir portões dimensionais através de uma energia paranormal que dá a eles superpoderes. Estes superpoderes são as únicas coisas que tem efeito sob os Invaders

A história da série se passa no ano de 2196, quando a Terra está em guerra contra uma raça de invasores alienígenas, os chamados "jupterianos". Após a derrota sofrida na Primeira Batalha de Marte, a Terra necessita de constante proteção em relação aos ataques desses inimigos, que utilizam naves não-tripuladas, tornando sua real aparência um mistério até os episódios finais. O destino do planeta então se encontra nas mãos da Nergal (ou "Industrias Nergal" como é apresentado no anime dublado), um poderoso conglomerado industrial que acaba de construir a última esperança para a salvação da Terra: uma poderosa nave de batalha, a ND-001 Nadesico. O que a Nergal não contava era que a tripulação seria o principal problema da nave.