A história se passa ao redor de Haruka e Yuu, duas garotas que frequentam um colégio que será fechado em três anos. Para dividir algo especial entre si, elas dividem um beijo, e sua relação se aprofunda daí em diante.
Isolada do resto da sociedade desde que sofreu uma experiência traumática, Hibiki Nukui tem como hobby usar programas de vocalização para criar e publicar músicas na Internet. Um dia, ele recebe um e-mail de algumas garotas do quinto ano que querem conhecê-lo e conversar pessoalmente com ele. Essas três garotas, que cresceram juntas quase como irmãs, lhe pedem ajuda para mostrar sua gratidão às pessoas que tomaram conta delas. O plano? Organizar um show de música num lugar cheio de lembranças.
A história gira em torno do psicólogo Ryou e sua enfermeira Asuna. A dupla explica os aspectos das doenças mentais através de uma série de casos pouco conectados. O "doutor" ajuda os expectadores a entenderem condições como depressão, transtorno de ajustamento e síndrome de Asperger.
Shibaki é um garoto do ensino médio, cujo único interesse é meninas. Só que ele foi marcado como o garoto mais hentai na escola e as meninas evitá-lo como uma praga. Um dia ele encontra um livro na biblioteca sobre como convocar bruxas. Ele tenta-lo como uma brincadeira, mas que acaba por ser a coisa real. Um aprendiz de bruxa chamada Rurumo parece conceder-lhe um desejo. Shibaki ajuda Rurumo e ela, em troca se recusa a tomar sua alma. (Esta parte desta história aconteceu antes do início da chapter1) Quando a história começa, Shibaki deseja que ele poderia ver Rurumo novamente. Seus desejos é concedido imediatamente como Rurumo cai do céu e terras acidente em frente a ele. Ele descobre que, como castigo por não levar a sua alma ela foi rebaixado a um demônio aprendiz. Agora, ela deve completar a tarefa de conseguir Shibaki usar até 666 bilhetes mágicos que concedem desejos antes que ela possa se tornar uma bruxa novamente. No entanto, o que ela não sabe é que cada vez que ele usa um bilhete que encurta sua vida. Quando o último bilhete é usado para cima, Shibaki vai morrer. Shibaki sabe disso porque conhece o gato preto de Rurumo Chiro dizer a ele como parte do “contrato” para dar-lhe os bilhetes. Agora, Shibaki tem uma escolha, faça um desejo e ajudar Rurumo tornar uma bruxa novamente ou resistir à tentação e tentar salvar sua própria vida.