Um cetro mágico comprado pela jornalista April O'Neill acidentalmente a transporta a para o Japão do século XVII. As Tartarugas Ninja também viajam no tempo no intuito de salvá-la, mas Michelangelo se perde do grupo. Para reencontrá-lo e salvar April, Donatello, Raphael e Leonardo precisam ajudar uma vila a enfrentar o malvado Lorde Norinaga.
Nos anos 1930, na cidade de Nova York, o milionário Lamont Cranston (Alec Baldwin) usa poderes ocultos para se tornar "O Sombra", um misterioso vigilante. Seu objetivo é fazer justiça e impedir que seu arqui-inimigo Shiwan Khan (John Lone), descendente de Genghis Khan, detone uma bomba atômica e domine o mundo. Para isso, o herói vai usar sua habilidades de invisibilidade e de confundir mentes para salvar a cidade ameaçada das mãos desse terrível vilão.
Hunt Stevenson trabalha para uma grande fabrican de automóveis que acaba de ser comprada por uma empresa japonesa. De repente, tendo que justificar seu próprio trabalho, ele é forçado a escolher entre a redundância ou a ética de trabalho japonesa aparentemente desumana que os novos proprietários trouxeram com eles.
A série segue as aventuras de Jackie Chan e sua sobrinha de 11 anos, Jade, enquanto lutam contra a misteriosa organização Mão Negra em busca de talismãs mágicos.